Các tổ chức giáo dục ở Bishkek bao gồm:

• APAP KR
• Đại học Mỹ-Trung Á
• Đại học bang Arabaev Kyrgyz
• Đại học Nhân văn Bishkek
• Đại học quốc tế Ataturk-Alatoo
• Đại học Quốc tế Kyrgyzstan
• Đại học Slavơ-Nga-Kyrgyz
• I.K. Học viện Y khoa bang Akhunbaev
• Đại học Quốc gia Kyrgyzstan
• Đại học kỹ thuật tiếng Kyrgyz
• Đại học Nhà nước Nga-Nga
• Đại học MANAS Tiếng Slovak-Thổ Nhĩ Kỳ
• Đại học Tiếng Slovak
• Đại học Quản lý và Thiết kế Plato
• Đại học Trung Á

Ngoài ra, các trường quốc tế sau đây phục vụ cộng đồng người nước ngoài ở Bishkek:

• Trường châu Âu ở Trung Á
• Trường quốc tế Oxford Bishkek
• Học viện Hy vọng Bishkek
• Trường quốc tế QSI của Bishkek
• Trường quốc tế Con đường tơ lụa